Внедрение новых технологий идентификации микроорганизмов ❯

15.09.2021 3:31:59

MALDI-TOF MS — метод ионизации, позволяющий ионизировать биологические макромолекулы (пептиды, белки, ДНК, олигонуклеотиды, липополисахариды и др.) в присутствии особого вещества — матрицы — под воздействием лазера (рисунок 1). За открытие метода Коити Танака, специалист известной японской приборостроительной корпорации Shimadzu получил в 2002 году Нобелевскую премию.

file_083303150921

Рисунок 1 – Принцип действия MALDI-TOF MS

Полученные ионы разделяются во времяпролетном анализаторе за счет разной скорости перемещения, обратно пропорциональной массе иона. На основании информации о пути перемещения иона от источника ионизации до детектора, а также о времени этого перемещения, вычисляется скорость движения иона и отношение массы к заряду (m/z) для каждого иона.

Использование в качестве исследуемого образца чистой культуры микроорганизма или его экстрактов позволяет получить спектр, специфичный для узких таксономических групп — рода, вида или даже штамма. На основе характеристик полученного спектра при помощи программных биоинформатических инструментов осуществляется идентификация исследуемого микроорганизма в чистой культуре либо в смешанных культурах.

Процесс идентификации основан на сравнении полученных масс-спектров с референсными спектрами, присутствующими в базах данных, поставляемых производителями вместе с оборудованием для MALDI-TOF MS. При достаточном количестве совпадений делается вывод о таксономической принадлежности исследуемых микроорганизмов к конкретной таксономической группе.

Результаты идентификации микроорганизмов не требуют дополнительного подтверждения классическими биохимическими тестами.

Внедрение данной технологии позволяет повысить точность определения микроорганизмов и существенно сократить сроки проведения исследований, так как сроки идентификации сокращаются с нескольких суток до нескольких минут.

Впервые на территории Оренбургской области реализуется революционный метод идентификации микроорганизмов. Микробиологическая лаборатория НИЦ ОрГМУ приступила к пуско-наладочным работам по монтажу микробиологического хромато масспектрометра (VITEK MS bioMerieux, Франция).